Bộ Giáo dục và Đào tạo (GDĐT) đã triển khai thực hiện Chương trình nghiên cứu khoa học giáo dục gồm 39 đề tài cấp Nhà nước về khoa học giáo dục; trong đó có những đề tài tập trung vào xây dựng môi trường giáo dục an toàn, lành mạnh, thân thiện; bảo đảm an toàn cho trẻ em; phối hợp giữa nhà trường – gia đình – cộng đồng trong chăm sóc, giáo dục trẻ em; công tác phối hợp liên ngành trong phòng, chống xâm hại trẻ em; nghiên cứu giải pháp phát triển công tác phát triển công tác tâm lý học trường học đáp ứng yêu cầu chương trình giáo dục phổ thông mới; Các hệ hình (paradigm) giáo dục ở Việt Nam – từ truyền thống tới hiện đại; nghiên cứu luận cứ đề xuất mô hình phối hợp liên ngành trong giáo dục phòng, chống xâm hại tình dục trẻ em.
Các nhóm nghiên cứu thường xuyên báo cáo cập nhật tiến độ, cung cấp những sản phẩm trung gian phục vụ công tác quản lý Nhà nước của Bộ (góp ý sửa đổi Luật Giáo dục, các giải pháp xây dựng môi trường giáo dục an toàn lành mạnh; các mô hình phòng chống bạo lực học đường…)
Bộ GDĐT đã chỉ đạo các địa phương, nhà trường xây dựng Kế hoạch phòng chống bạo lực học đường; thiết lập các kênh thông tin (đường dây nóng, hộp thư góp ý, hệ thống camera giám sát…) để tiếp nhận, xử lý kịp thời các thông tin về bạo lực học đường; báo cáo công tác xử lý đến các cấp quản lý.