Trong quá trình triển khai nhiệm vụ thực hiện các biện pháp hòa giải ở cơ sở trong việc xử lý các vụ bạo lực gia đình đối với phụ nữ, Bộ Tư pháp cũng gặp một số khó khăn, hạn chế như kinh phí bảo đảm cho công tác phổ biến giáo dục pháp luật còn hạn hẹp chưa đáp ứng được nhu cầu phổ biến giáo dục pháp luật của người dân; nguồn nhân lực thực hiện công tác phổ biến giáo dục pháp luật thiếu về số lượng, yếu về trình độ chuyên môn; đặc biệt những vùng biên giới, hải đảo, vùng sâu, vùng xa, vùng có điều kiện kinh tế khó khăn; hiệu quả phối hợp giữa các Bộ, ngành, cơ quan có liên quan, trong đó có phối hợp với Bộ Thông tin và Truyền thông trong công tác phổ biến giáo dục pháp luật còn hạn chế. Bên cạnh đó, công tác tuyên truyền, phổ biến pháp luật về phòng, chống bạo lực gia đình mặc dù có nhiều cố gắng nhưng chưa thực sự tạo chuyển biến rõ nét trong xã hội, tình trạng bạo hành giữa các thành viên trong gia đình (đặc biệt đối với phụ nữ và trẻ em) vẫn xảy ra phổ biến ở nhiều nơi, nhiều vụ việc với mức độ nghiêm trọng.
Hoạt động trợ giúp pháp lý cho phụ nữ là nạn nhân bạo lực gia đình hiện nay còn gặp phải một số rào cản như:
Thứ nhất, sự phối hợp của các cơ quan, đơn vị trong việc trợ giúp pháp lý cho phụ nữ là nạn nhân bạo lực gia đình có lúc, có nơi còn chưa hiệu quả. Việc thực hiện chuyển, gửi vụ việc từ các cơ quan liên quan đến tổ chức thực hiện trợ giúp pháp lý và ngược lại chưa được thường xuyên, nội dung truyền thông về bình đẳng giới và phòng, chống bạo lực gia đình chưa phong phú.
Thứ hai, một số cán bộ thực hiện trợ giúp pháp lý ở một số địa phương chưa được đào tạo bài bản về kỹ năng làm việc với nạn nhân bạo lực gia đình. Một số trung tâm trợ giúp pháp lý nhà nước chưa bố trí được địa điểm tiếp riêng cho những nạn nhân của bạo lực gia đình, nạn nhân bị mua bán, nạn nhân bị xâm hại tình dục.