Trong giai đoạn (từ 2008 đến 2020) nguồn kinh phí Chương trình Mục tiêu quốc gia (giai đoạn 2008-2015) và Chương trình Mục tiêu Y tế- Dân số (giai đoạn 2016-2020) cũng như nguồn kinh phí do Liên minh Châu Âu hỗ trợ, công tác chăm sóc sức khỏe bà mẹ, trẻ em/sức khỏe sinh sản được đầu tư khoảng 434.485.000.000 đồng (khoảng 440 tỉ đồng), theo ước tính thì số kinh phí đầu tư trực tiếp cho công tác chăm sóc sức khỏe bà mẹ, trẻ em và trẻ sơ sinh chiếm khoảng 1/3 tổng số kinh phí trên (ước khoảng 145 tỉ đồng), với số kinh phí được đầu tư như trên và phân bố cho 63 tỉnh/thành phố thì chưa thể đáp ứng được nhu cầu để triển khai các can thiệp nhằm giảm tử vong trẻ em. Số kinh phí còn lại được đầu tư cho một số nội dung khác về chăm sóc sức khỏe sinh sản như: Sức khỏe sinh sản vị thành niên, thanh niên; Giảm phá thai và phá thai an toàn; Kế hoạch hóa gia đình; …
Ngoài nguồn kinh phí đầu tư của nhà nước, giai đoạn này, Bộ Y tế cũng đã huy động được kinh phí viên trợ (khoảng 02 triệu USD~ 45 tỉ đồng) từ các tổ chức quốc tế (bao gồm cả các tổ chức thuộc Liên hợp quốc) để triển khai các can thiệp chăm sóc sức khỏe bà mẹ, trẻ em trên toàn quốc.
Nguồn kinh phí nêu trên cũng phần nào ảnh hưởng đến việc chăm sóc sức khỏe bà mẹ, trẻ em trong gia đình, nhất là trẻ em dưới 5 tuổi.