Công tác phối hợp liên ngành trong triển khai công tác BĐG nói chung và Chiến lược nói riêng ngày càng được quan tâm hơn. Với vai trò là cơ quan quản lý nhà nước về BĐG, Bộ LĐTBXH đã chủ động, tích cực phối hợp với Ủy ban về các vấn đề xã hội của Quốc hội, Văn phòng Chính phủ, Bộ Văn hóa, Thể thao và Du lịch, Bộ Kế hoạch và Đầu tư, Bộ Tư pháp, Bộ Tài chính, Bộ Nội vụ, Bộ Y tế, Ban Tổ chức Trung ương, Ban Dân vận Trung ương, Trung ương Hội Liên hiệp Phụ nữ Việt Nam, Ủy ban quốc gia vì sự tiến bộ của phụ nữ Việt Nam và các bộ, ngành chức năng liên quan trong việc tham mưu xây dựng, tổ chức thực hiện và kiểm tra, giám sát chính sách, pháp luật về BĐG; công tác cán bộ nữ; công tác phòng, chống bạo lực trên cơ sở giới, BLGĐ; giảm thiểu mất cân bằng giới tính khi sinh;…
Ngày 17/10/2020, Bộ LĐTBXH và Trung ương Hội Liên hiệp Phụ nữ Việt Nam đã ký kết Chương trình phối hợp giữa Bộ LĐTBXH và Trung ương Hội Liên hiệp Phụ nữ Việt Nam giai đoạn 2019 – 2022. Mục tiêu của Chương trình nhằm tăng cường sự phối hợp chặt chẽ, toàn diện và hiệu quả giữa hai bên trong việc đề xuất, xây dựng và thực hiện các chủ trương, đường lối của Đảng, chính sách, pháp luật của Nhà nước, các cam kết quốc tế về BĐG, vì sự tiến bộ của phụ nữ và sự phát triển toàn diện của trẻ em trong các lĩnh vực lao động, người có công và xã hội; nâng cao nhận thức, năng lực nghiên cứu, tham mưu xây dựng chính sách, pháp luật và tổ chức triển khai thực hiện cho đội ngũ cán bộ hai bên về giới, lồng ghép giới, BĐG, công tác vì sự tiến bộ của phụ nữ, công tác bảo vệ trẻ em, phòng, chống bạo lực, xâm hại trẻ em đảm bảo chất lượng, hiệu quả; nâng cao hiệu quả phối hợp kiểm tra, giám sát chính sách, pháp luật về BĐG, công tác phụ nữ, trẻ em trong lĩnh vực lao động, người có công và xã hội.
Sự phối hợp liên ngành đã góp phần nâng cao hiệu quả quản lý nhà nước, tăng cường các nguồn lực cho việc thực hiện thành công các mục tiêu về BĐG.