Kinh phí thực hiện nhiệm vụ về phòng, chống xâm hại trẻ em chưa có. Các đơn vị thuộc Bộ đang lồng ghép nội dung này vào các nhiệm vụ chuyên môn và lấy kinh phí từ nguồn văn hóa, gia đình, thể thao và du lịch đều thực hiện trong phạm vi rất ít chứ chưa có nhiệm vụ này.
Trẻ em là thành viên gia đình; gia đình có vai trò quan trọng với việc phòng, chống xâm hại tình dục trẻ em. Tuy nhiên hiện nay, đội ngũ cán bộ thực hiện công tác gia đình đang thiếu về số lượng và kinh nghiệm, chưa có đội ngũ công tác viên ở cơ sở.
Công tác phối hợp trong lĩnh vực trẻ em với các Bộ, Ban, ngành liên quan chưa thường xuyên và hiệu quả.
Kiến thức chung về kỹ năng chăm sóc, bảo vệ và giáo dục trẻ em trong gia đình, nhất là ở những vùng sâu vùng xa, vùng đồng bào dân tộc thiểu số còn rất nhiều hạn chế.